SD Kristen Petra 11 menggunakan Kurikulum Tingkat Satuan Pendidikan (KTSP) berdasarkan UU Nomor 20, Tahun 2003, tentang Sistem Pendidikan Nasional yang mengamanatkan pengelolaan pendidikan dilaksanakan secara terdesentralisasi.

KTSP adalah kurikulum operasional yang disusun dan dilaksanakan oleh tiap-tiap satuan pendidikan, dengan berpedoman pada Standar Isi (SI) dan Standar Kompetensi Lulusan (SKL) yang ditetapkan oleh Badan Standar Nasional Pendidikan (BSNP).

Berdasarkan kurikulum dan visi dari SD Kristen Petra 11, program-program yang disusun adalah program-program pengajaran yang menumbuhkan kreativitas, kemampuan, potensi, sikap moral, sikap emosional, dan sikap sosial yang tinggi dalam diri siswa.

Program penunjang pelaksanaan kurikulum KTSP dibuat agar tujuan pendidikan dapat tercapai.

Program-program tersebut antara lain:

1. Pendidikan Nilai: honesty, respect, responsibility.
   Nilai-nilai kejujuran, hormat, dan tanggung jawab, ditanamkan sejak dini dan berkesinambungan untuk membentuk manusia yang holistik, bukan saja pandai dalam segi inteligensia, tetapi juga baik dalam tutur kata, sikap, dan perbuatan. SD Kristen Petra 11 memberikan penghargaan bagi para siswa yang dapat melakukan ketiga nilai di atas dalam lingkungan sekolah, melalui pemberian pin.
2. Joyful Learning - (program unggulan).
   Program pembelajaran yang menyenangkan, akan meningkatkan daya serap siswa dalam memahami materi pelajaran. Kegiatan belajar mengajar tidak hanya dilakukan di dalam kelas, tetapi juga di luar kelas, serta menggunakan bermacam variasi alat peraga atau media pembelajaran yang sesuai, sehingga siswa dapat menikmati kegiatan belajarnya.
3. Radio Sekolah (P-eleven Student Broadline) - (program unggulan).
   Memberi wadah untuk pengembangan kreativitas siswa dalam acara radio yang disiarkan melalui sentral bagi para siswa. Melibatkan siswa dalam menyiapkan acara-acara radio, sehingga mereka berlatih menjadi presenter radio, wartawan cilik, operator, dan sebagainya. Bukan hanya itu saja, program acara yang dibuat pun menggunakan empat bahasa (Inggris, Jawa, Mandarin, dan Indonesia).
   Tujuan program radio sekolah:
   • Memberi wadah bagi siswa dalam mengembangkan bakat dan kreativitas mereka.
   • Meningkatkan/mengembangkan keterampilan siswa dalam berkomunikasi.
   Program Acara:
   
   • Dialog (wawancara, konsultasi kesehatan/masalah belajar, dan sebagainya).
   • Berita Seputar SD Petra 11 (P–11 News).
   • Dunia Pengetahuan Kita (pengetahuan tambahan di luar buku pelajaran).
   • Apresiasi Sastra (Pantun, Puisi, Drama Radio, Telling Story, dan sebagainya).
   • P-11 Christian Kids (program pembinaan rohani Kristen).
   • Iklan Membangun.
   • Lagu dan Salam (permintaan lagu-lagu rohani dan pembacaan salam/pesan).
   • Tips/Anekdot.
   Setiap tahun P-eleven Student Broadline mengadakan audisi penyiar/tim radio sekolah untuk mencari generasi baru yang akan menggantikan tim radio sekolah yang telah lulus.
4. Ekstrakurikuler.
   Ekstrakurikuler di SD Kristen Petra 11 terbagi menjadi dua jenis kegiatan, yaitu:
   1. Excellent Life Skill, adalah program pendidikan life skill unggulan yang bertujuan mengembangkan potensi dan bakat siswa di bidang nonakademik.
      Kegiatan Excellent Life Skill (ELS) yang terdiri atas:
      • Cooking Class (bagi siswa kelas IV).
      • Presenter (bagi siswa kelas V dan VI).
      • Bahasa Inggris (bagi siswa kelas V dan VI).
      • Menggambar Kreatif (bagi siswa kelas V).
   2. Kegiatan Ekstrakurikuler yang terdiri atas: seni musik, seni tari, menggambar, bahasa Inggris.
5. Kegiatan Kerohanian.
   "Takut akan Tuhan adalah permulaan segala hikmat dan pengetahuan“,  Amsal 1:7a, adalah landasan dan ciri khas SD Kristen Petra 11 dalam melangkah menyiapkan anak didik bertumbuh dan berkembang mencapai kepribadian yang utuh dan dinamis, intelek, berjati diri, sadar akan lingkungan dan ciptaan Tuhan, bermoral dan berbudi pekerti.
   SD Kristen Petra 11 mewujudkan hal tersebut dalam bentuk kegiatan rohani, seperti:
   
   • Persekutuan doa.
   • Retret.
   • Peribadatan.
   • Peringatan/perayaan hari besar.
   • Bakti sosial Paskah.
6. Karya wisata.
   Kegiatan belajar mengajar bukan hanya dilakukan di dalam lingkungan sekolah. Tetapi setiap tahunnya, juga dilakukan kegiatan belajar di luar sekolah melalui karyawisata. Tujuannya adalah untuk menambah wawasan atau pengalaman siswa di lingkungan masyarakat yang sesungguhnya dalam kehidupan sehari-hari.
7. Character Building.
   Program pengembangan karakter dan kepribadian anak, yang bertujuan agar siswa-siswi PPPK Petra memiliki karakter dan kepribadian unggul serta matang, demi tercapainya pendidikan yang menyeluruh (holistic education).

• Dilaksanakan setiap hari Sabtu (khusus hari Sabtu, minggu ke-5 libur).
• Dimulai pada tanggal 1 Agustus 2010.
• Waktu: pukul 07.00—10.00.
• Dilaksanakan di ruang aula sekolah dan di ruang kelas.