Dalam menunjang proses belajar mengajar, sekolah menyediakan beberapa fasilitas yang dapat meningkatkan mutu pembelajaran. Fasilitas-fasilitas tersebut dilengkapi dengan media yang memadai.

Ruang Media

Sebuah fasilitas sekolah yang menyediakan berbagai macam alat untuk mengajar, seperti: televisi, komputer, LCD, DVD player, dan lain-lain. Ruangan ini dibangun supaya proses belajar mengajar menjadi lebih menyenangkan. Dengan ruangan yang cukup besar, ditambah dengan adanya AC, membuat murid-murid menjadi nyaman.

Laboratorium

Untuk mendukung dalam pembelajaran IPA, sekolah menyediakan laboratorium bagi murid-murid agar dapat melakukan berbagai macam percobaan. Di ruang laboratorium juga dilengkapi mikroskop motic, torso, penampang ikan, dan lain lain. Setiap hari Kamis, ruang ini digunakan untuk ekstrakurikuler KIR, sehingga mereka semakin mempunyai banyak kesempatan untuk melakukan percobaan.

Perpustakaan

A book is a window of the world, yang berarti bahwa buku adalah jendela dunia. Dengan membaca banyak buku, berarti pengetahuan para siswa bertambah. Di perpustakaan ini, sekolah menyediakan bermacam-macam buku, seperti fiksi, biografi, pengetahuan, kamus, dan masih banyak lagi. Para murid juga berkesempatan untuk menjadi pustakawan kecil. Mereka bertugas melayani teman-temannya pada waktu peminjaman dan pengembalian buku.

Ruang Serbaguna

Ruangan ini merupakan ruangan yang terbesar di SD Kristen Petra 9. Ruang ini mempunyai banyak fungsi, dan dapat menampung hingga tiga ratus orang. Biasanya ruangan ini digunakan untuk persekutuan doa, pertemuan orang tua murid, ceramah, perayaan perayaan khusus, dan ekstrakurikuler.

Ruang Komputer

Menjadi suatu tuntutan bagi kita, baik guru maupun murid, untuk bisa mengoperasikan komputer. Dengan kemajuan teknologi yang begitu cepat, kita dituntut untuk mampu beradaptasi dan mengikuti perkembangan zaman. Petra menjalin hubungan dengan sebuah lembaga komputer, di mana siswa memperoleh pelajaran komputer dari guru-guru yang kompeten di bidangnya.

Lapangan

SD Kristen Petra 9 mempunyai 3 lapangan: 2 di dalam, dan 1 di luar. Lapangan di luar biasa digunakan untuk upacara bendera, sedangkan dua lapangan yang ada di dalam biasa digunakan untuk olahraga dan bermain. Mereka dapat bermain bola basket, bola voli, senam, bulu tangkis, dan lain lain. Dengan adanya lapangan yang luas, akan membuat para murid dapat melakukan banyak hal secara bebas, baik pada waktu mereka olahraga, maupun pada saat mereka istirahat.