Kurikulum dikembangkan sebagai pedoman untuk menyelenggarakan kegiatan pembelajaran, dalam mencapai tujuan pendidikan tertentu. Tujuan tertentu ini meliputi tujuan pendidikan nasional, serta kesesuaian dengan kekhasan, kondisi, potensi daerah, satuan pendidikan, dan peserta didik. Oleh karena itu, Kurikulum Tingkat Satuan Pendidikan (KTSP) SD Kristen Petra 9 dikembangkan sebagai perwujudan dari kurikulum pendidikan dasar dan menengah. Kurikulum ini disusun oleh satu tim penyusun yang terdiri atas unsur sekolah dan komite sekolah, di bawah koordinasi dan supervisi Dinas Pendidikan Kota Surabaya, serta dengan bimbingan narasumber (ahli pendidikan dan pengajaran) dari Puslitbangdik dan Direktorat Pendidikan PPPK Petra.

Untuk mengembangkan visi dan misi SD Kristen Petra 9, disusunlah sebuah kurikulum yang didasari oleh honesty, respect, dan responsibility. Pembelajaran baik di kelas maupun di luar kelas, hendaknya berjalan secara efektif, yang mampu membangkitkan aktivitas dan kreativitas anak.

Kegiatan Ekstrakurikuler

Dari sekian banyak kegiatan ekstrakurikuler yang dilaksanakan di SD Kristen Petra 9, kami juga mempunyai program unggulan, ekstrakurikuler jurnalistik. Program ini kami jadikan sebagai program unggulan, karena sekolah ingin memfasilitasi para murid dan guru agar terbiasa menuangkan ide–ide dalam bentuk tulisan. Salah satu hasil yang telah dicapai oleh  peserta ekstrakurikuler jurnalistik beserta para guru adalah majalah Efata. Majalah Efata ini terbit setahun dua kali.

Joyful Learning

Salah satu jenis pengajaran yang membuat para murid merasakan suatu kegembiraan pada waktu mereka belajar. Guru dituntut untuk dapat menyajikan proses belajar mengajar yang menyenangkan, dengan mengunakan berbagai macam media. Dengan adanya joyful learning, murid dapat belajar dengan cepat dan dapat praktik secara langsung.

Life Skill

Murid diajarkan untuk melakukan suatu kegiatan yang tidak mereka dapat pada saat pembelajaran, sehingga mereka dapat menunjukkan kemampuannya, seperti: memasak, mengupas buah-buahan, membuat minuman, dan lain lain. Kegiatan ini sangat berguna untuk para murid dalam kehidupan sehari-hari.